Я планирую установить плоский аккумулятор, поэтому багажник останется в наличии. Решил сначала установить электромотор обязательно сзади, а потом уже решать возникающие проблемы
Подход правильный, транец сзади - это главное, остальное вторично.
При положенном вперед моторе пространство , оставшееся между ним и спинкой сиденья трудно назвать просторным багажником. Если идти с ночевкой (а мотор как раз позволяет уходить подальше), груза будет прилично: палатка, спальник, продукты, другое снаряжение.
Относить место крепления мотора еще дальше назад - появится проблема жесткости, вибрация.
Проще сделать легкие багажные рамки сзади на баллонах специально для таких случаев